Knjiga prati povijesni razvoj svijesti Crkve o samoj sebi kroz prva dva tisućljeća kršćanstva, s posebnim naglaskom na Drugi vatikanski koncil i njegovu dogmatsku konstituciju o Crkvi Lumen gentium, koja je obnovila razumijevanje Crkve kao otajstva, naroda Božjega i sakramenta spasenja.

U Ecclesia Christi subsistit in Ecclesia catholica. Katolička ekleziologija u ekumenskoj perspektivi, postkoncilska ekleziologija prikazana je kroz misli trojice istaknutih teologa – Oscara Cullmanna, mitropolita Hilariona Alfeyeva i Josepha Ratzingera – te kroz zajedničke ekumenske dokumente Katoličke Crkve i njezinih partnera.

Knjiga se ističe svojim ekumenskim pristupom, uključujući perspektive drugih kršćanskih Crkava i zajednica, te popis relevantnih hrvatskih eklezioloških djela nakon Drugog vatikanskog koncila, poput radova Mata Zovkića, Rudolfa Brajčića i drugih.

Autor ističe da, unatoč povijesnim podjelama, Božja milost može dovesti do “pomirene različitosti” u ključnim pitanjima poput papinskog primata i apostolskog naslijeđa, vodeći prema punom vidljivom jedinstvu u trećem tisućljeću.

Ecclesia Christi subsistit in Ecclesia catholica potiče na kontinuirano promišljanje o Crkvi kao otajstvu koje nikada nije do kraja iscrpljeno, ali uvijek poziva na obnovu i jedinstvo u Kristu.